结构功能在线预测

核酸序列的预测分析
 重复序列分析
CENSORhttp://www.girinst.org/
RepeatMaskerhttp://ftp.genome.washington.edu/cgi-bin/RepeatMasker
Xblast程序http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/
 数据库搜索
NCBI的BLASThttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/
 编码区统计特性分析:
GRAILhttp://compbio.ornl.gov/Grail-1.3/
GenMARKwww.genmarkag.com/
tRNAscan-SEhttp://www.genetics.wustl.edu/eddy/tRNAscan-SE/
GENSCANhttp://genes.mit.edu/GENSCAN.html

蛋白质结构和功能的预测分析
 预测蛋白质的物理性质
ExPASyhttp://www.expasy.ch/tools/
PROPSEARCHhttp://www.embl-heidelberg.de/prs.htm
SAPShttp://www.isrec.isb-sib.ch/software/SAPS_form.html
 蛋白质二级结构预测 :
NnPredicthttp://www.cmpharm.ucsf.edu/~nomi/nnpredict.html
PredictProtein（国内镜像）：http://www.cbi.pku.edu.cn/predictprotein/
Tmpred http://www.ch.embnet.org/software/TMPRED_form.html
SignalPhttp://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/
 蛋白质三维结构预测 :
SWISS-MODELhttp://www.expasy.ch/swissmod/SWISS-MODEL.html
PSI-BLAST http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/